!" # 菌株生态学与生理生化特征
依据文献[!$%!&]对筛选出的菌株进行形态和
生理生化特征鉴定。
!" #" ! 革兰氏染色法’ 首先在超净工作台内挑取单
菌落到加有少量生理盐水的载玻片上,自然风干;再
滴加少量结晶紫染料初染 ! ()* 之后用流水冲洗;
然后加入少量碘液放置 ! ()* 之后用流水冲洗;再
加少量 +$, 乙醇,脱色 -. / 之后用流水冲洗;最后
加入番红复染 ! ()*,用清水冲洗后,镜检。
!" #" 0 接触酶实验’ 将接种培养 0# 1 的斜面菌种以
接种环取一小环涂抹于已滴有 -, 2
0
3
0
的玻片上,
如有气泡产生,则为阳性,反之为阴性。
!" #" - 碳源和氮源利用实验’ 从平板中挑取单菌落
进行液体培养 !4 5 0# 1,以菌悬液接种连续 - 代移
种于灭了菌的碳源利用培养液,浑浊为阳性,反之为
阴性;将培养 !4 5 0# 1 的菌液接种到氮源利用培养
液中,适温培养 - 5 6 7,与空白试管对比,较浑浊为
阳性,反之为阴性。
!" #" # 耐盐性实验 ’ 将幼龄菌株接种在 0, 、$, 、
6, 和 !., 的不同浓度 89:; 的 <= 培养基中,适温
培养 - 5 6 7,与未接种的试管对比,自测生长情况。
!" $ 菌株分子生物学鉴定
!" $" ! 菌株总 >8? 提取’ 从超低温冰箱中取出保
存的上述甘油菌液,先划线培养出单菌落,然后挑取
单菌落进行摇瓶培养 -6 @ 过夜。以 $ ... A・()*
B !
离心 - ()*,收集菌沉淀,准备提取总 >8?。应用淤
泥基因组 >8? 快速提取试剂盒( 离心柱型,购于北
京百泰克生物技术有限公司)并按照该试剂盒介绍
的操作步骤提取菌液总 >8?。
!" $" 0 对提取的 >8? 序列 C:D 扩增’ 通过 EA)(FA
EAF()FA $" . 软件设计 !&G A>8? 上、下游引物,其中
上游引物为 $H%I?I ?IJ JJI ?J: :JI I:J :?I%
-H;
下 游 引 物 为 $H%??I I?I IJI ?J: :?I ::I
:?%-H;
对菌液总 >8? 序列进行 C:D 扩增。C:D 反
应体系为:
!. K <? J9L MNOOFA ." $ !<,78JC # !<,模
板 >8? ." $ !<,上游引物 ! !<,下游引物 ! !<,
772
0
3 -4 !<,<? J9L ." $ !<,共 $. !<。C:D 反应
条件为:
+# @ 预 变 性 $ ()*,+# @ 变 性 #$ /,退 火
$$ @ ,
#$ /,60 @ 延 伸 +. /,共 0$ 个 循 环,之 后
60 @ ,
!. ()*,
# @ 保存。C:D 产物用 0, 琼脂糖凝
胶电泳检测。
!" $" - 对 C:D 产物测序’ 将 C:D 产物送往基因公
司测序,并在 IF*M9*P 数据库里进行比对,找出被筛
菌种属等。
0 结果
0" ! 菌株形态学鉴定
经鉴定该菌为革兰氏阴性菌,
细胞卵圆形或杆状,
单个或短链状排列。菌落呈橘红色或橘黄色,表面湿
润,
不透明。细胞表面产生粘液或生有荚膜。经芽孢
染色证明此菌株不产芽孢,
接触酶实验呈阳性结果。
0" 0 菌株生理生化鉴定
对该菌株进一步进行生理生化鉴定,根据文献
[!$]所述该菌株跟类球红细菌属 !"#$#%&’()* +,- 特点
相似。在碳源利用率试验中,
不加碳源的不生长,
加葡
萄糖为唯一碳源比用乙酸钠为唯一碳源的生长状态要
好。在氮源利用率实验上,空白不生长,加 82
#
2
0
C3
#
比加 Q83
-
生长的状态差。在耐盐性试验中,
该菌株对
89:; 的耐受性浓度依次为:
6, R $, R 0, R 空白,
在
!., 的 89:; 浓度下该菌不生长
(表 !)。
表 !’ 能量利用实验结果和耐盐性实验
实验项目
菌株反应
空白
B
碳源利用实验
葡萄糖
S S S
乙酸钠
S S
空白
B
氮源利用实验
82
#
2
0
C3
#
S S
Q83
-
S S S
空白
S S S S
0, 89:;
S S S
耐盐性实验
$, 89:;
S S
6, 89:;
S
!., 89:;
B
’ ’ 注:
“ S ”表示阳性反应,
“ S ”越多说明反应越强;
“ B ”表示阴性结
果。
0" - !&G A>8? 的基因序列分析
以菌株总 >8? 为模板,利用设计的上、下游引
物进行 !&G A>8? 扩增,电泳结果证实约在 ! $.. ME
处有清晰可见明亮的单条带( 图 !)。
注:T 为 >8? (9APFA;! 为 C:D 扩增产物
图 !’ !&G A>8? 序列 C:D 扩增产物电泳图
0
+
重庆师范大学学报( 自然科学版)’ 1UUE:V V WWW" XL*NY" X*’ ’ ’ ’ ’ ’ ’ ’ ’ ’ 第 0+ 卷